然而，并非所有患者都能依赖自愈若免疫力持续低下如长期熬夜压力过大或患有慢性疾病，或病毒载量较高，扁平疣可能不会自行消失，反而逐渐增多增大，甚至扩散至面部颈部四肢等部位此外，搔抓或摩擦患处可能导致病毒接种传播，进一步加重病情因此，当出现扁平疣时，不建议单纯等待其自愈。

扁平疣一般在发病2年左右会自行消失，但部分患者可持续数年不愈多数情况扁平疣是一种慢性病程的皮肤病，多数患者在发病后的2年左右会自行消失个体差异然而，也有部分患者会持续数年不愈，这时需要考虑进行抗病毒治疗或光动力治疗自愈征兆在扁平疣即将痊愈时，可能会出现皮疹突然增多或瘙痒加剧的。

部分扁平疣患者可自行消失，约65%的患者在2至3年内自然消退，但并非所有情况均能自愈其自行消退与机体免疫系统对抗人乳头瘤病毒HPV的能力密切相关当人体免疫力较强时，免疫细胞可识别并清除被HPV感染的细胞，促使疣体逐渐消退自愈过程中，疣体通常会先变红发痒，随后变平并消失，且一般不留。

扁平疣存在自愈可能，但并非所有患者均能自愈，且自愈时间不固定一自愈概率与时间约65%的扁平疣患者可在23年内自愈，主要依赖自身免疫系统清除人乳头瘤病毒HPV自愈时间差异较大，短至数月，长则数年免疫系统功能较弱者如老年人慢性病患者自愈概率显著降低二影响自愈的关键因素 年。